ไม่ทราบประวัติที่ชัดเจน ทราบว่าริมคลองหน้าวัดมีต้นตะกูจำนวนมาก ตั้งชื่อตำบลว่าตำบลบางตะกู วัดจึงอนุโลมตามชื่อของตำบล เพราะบริเวณมีเพียงวัดเดียว ภายหลังมีผู้เปลี่ยนคำนำหน้าจากบางมาเป็นวังให้คล้องกับตำบลวังกะพีที่อยู่ใกล้กันจึงได้ใช้ชื่อว่า “วัดวังตะกู” ตั้งแต่นั้นเป็นต้นมา